1920 год ознаменовался важным событием для Пятигорска. В этом году был открыт первый в стране Бальнеологический институт, сыгравший огромную роль в развитии кавказских курортов. В первые годы Советской власти город восстанавливался после разрушений Гражданской войны. Уже к 1930 году все курорты Кавминвод имели свой отчетливый лечебный профиль, показания для лечения и должную медицинскую структуру.
В 1935 году было решено провести реконструкцию курорта. Однако все планы по благоустройству города прервались в результате нападения фашистов на Советский Союз. Санатории Пятигорска превратились в госпитали. На Северном Кавказе сражения начались летом 1942 года и спустя несколько месяцев город оккупировали гитлеровцы. За 5 месяцев оккупации Пятигорску был нанесен громадный ущерб: лаборатория Бальнеологического института была разрушена, научная библиотека уничтожена, вывезено дорогое оборудование, повреждены санатории, огромные убытки понесло все городское хозяйство. В начале 1943 года Пятигорск освободили и сразу принялись за восстановительные работы, на которые были выделены значительные средства.
Несмотря на трудности, город в 1947 году достиг довоенного уровня развития и в сфере культуры и в сфере экономики.
С 1950 года начался следующий этап в развитии курорта. В этот период проводятся крупнейшие гидрогеологические исследования, в результате которых в городе и окрестностях выявлены источники новых минеральных вод.
За успехи, полученные трудящимися города в культурном и хозяйственном строительстве и в развитии здравоохранения, а также за заслуги в становлении на Северном Кавказе Советской власти и в борьбе с фашистскими захватчиками во время войны, и в связи с 200-летием с даты основания, Пятигорск был вознагражден орденом Трудового Красного Знамени.