На месте Генуэзской фактории турками была построена небольшая крепость, которую назвали Анапой. Крепость Анапы была оснащена 12-ю пушками и имела небольшой гарнизон, который насчитывал около 200 человек. Крепость Анапа выполняла не только роль защитной функции, но и считалась центром работорговли на Черном море. Со всех сторон гор на территорию Анапы были проложены многочисленные тропинки, именно по ним горские племена приводили в Анапу пленников на продажу. В период начала Русско-Турецких войн крепость Анапа начинает укрепление своих стен, расширение территории и возведение новых укреплений. Количество гарнизона значительно увеличивается. После того, как Турецкие войска сдали Крым, крепость Анапа стала главной турецкой крепостью на территории северного Причерноморья.
Анапа имела важное и стратегическое значение. Понимая это, русские войска на протяжении 40 лет (с 1788 года по 1828 год) отправляли 7 походов на ее взятие, но все они закончились безрезультатно. Овладеть Анапой удалось только в 1929 году, тогда был заключен Адрианопольский мирный договор.