Уже в 1850 году будущий император Александр II посетил станицу Невинномысскую. Его встречали и сопровождали до Пятигорска почетным эскортом.
В состав Кубанского казачьего войска станица Невинномысская и рядом стоящие станицы вошли в 1860 году. Когда закончилась Кавказская война, мирный Ставропольский край стал самым богатым аграрным регионом России. Стремительно шло развитие тонкорунного овцеводства. Крупный рогатый скот перегонялся для продажи в центральные губернии. Производство зерна росло с каждым годом все больше и больше. Население станицы увеличивалось.
Развитие станицы росло. В 1872 году началась постройка железнодорожной линии. Проведение железнодорожной магистрали между Ростовом-на-Дону и Владикавказом закончилось в 1875 году. Это помогло развитию станицы в промышленном отношении. Выращенное зерно перерабатывали на мельнице, которую построили и запустили в 1894 году. Она являлась одной из самых крупных паровых мельниц на Северном Кавказе. Переработанную муку с помощью железной дороги доставляли в другие регионы и города страны. Знаменитая Ставропольская мука очень пользовалась спросом в Москве и Санкт-Петербурге. В станице продолжали строить фабрики, и спустя год после мельницы, в станице возвели самую крупную в империи России фабрику по обработке шерсти купца И.А.Лапина.
Благодаря плодородию и богатству станицы, в Невинномысск начали прибывать предприниматели, строя себе шикарные особняки на берегах речки. Их манили сюда крупные масштабы торгового оборота. Чтобы уменьшить безграмотность своих жителей, люди начали строить школы, для развлечений начали использовать первый синематограф. В самом центре, уже в процветающей к тому времени станицы Невинномысская, возвели новый православный храм Покрова Пресвятой Богородицы. Уже тогда она ушла далеко вперед от своих соседей, Беломечетской и Барсуковской станиц.