Военные походы русских на Астраханское ханство в 1552-1556 годах привели к тому, что Московское царство присоединило обширные территории Поволжья. В годы царствования Федора Ивановиче началось возведение на Волге городов-крепостей: Самары (1586), Царицына-Волгограда (1589) и Саратова (1590). Основателями города считаются боярин Федор Туров и князь Григорий Засекин.
Первоначальное место основания города определить точно не удалось: данные варьируются от левобережной Анисовки до правобережного Приставного. Зимой 1613- 1614 гг. Саратов сгорел и был построен заново в 1617 г. в устье р. Саратовка, на левом берегу Волги, АО по указу царя Алексея Михайловича в 1674 г. перенесен на правый берег, к современной Музейной площади.
Город-крепость отличался сильным гарнизоном, который должен был оберегать русские земли от экспансии со стороны соседних татар, козаков и калмыков. Саратов заселялся преимущественно теми, кого привлекала вольная козачья жизнь и безнаказанность, с которой можно было грабить поволжские территории, поэтому оседлым земледельческим хозяйством здесь стали заниматься еще довольно нескоро. В 1670 гг. город стал жертвой трехдневного грабежа Степана Разина, а в 1708 г. выдержал осаду войск Булавина.