1941 год нарушил мирные планы всего Советского Союза. В военкоматы, комсомольские и партийные организации поступило 6000 заявлений с просьбой об отправке на фронт. Рабочие кожзавода, швейной фабрики, «Красного металлиста», железнодорожного узла, мясокомбината добровольно перешли на ненормированный рабочий день. Город начал поставлять на передовую продовольствие, обмундирование, военное снаряжение, боеприпасы, миномёты.
В августе 1942 года Ставрополь оккупировали немецкие солдаты. Это было страшное испытание для жителей города. Новый порядок, который установили немцы, начался с расстрелов советских патриотов, комсомольцев, коммунистов. Десятого августа гитлеровцы убили 660 человек в ставропольской больнице. Ещё за один день у родника расстреляли 4000 человек. За время оккупации от рук фашистов погибло 10000 местных жителей.
В 1943 году советские войска начали наступать на Кавказ, оттесняя врагов. Немцы стянули в Ставрополь остатки дивизий и полков, технику, желая серьёзно обороняться. К вокзалу привезли шестиствольные миномёты, артиллерию, 300 автомашин, танки. Планомерное разрушение города начала специальная группа.
Первым подошёл 1177 полк М.В. Львова, затем 1175 полк А.Е. Короткова, с севера зашло 1179 подразделение А.Н. Гервасиева. В январе 1943 года Ставрополь освободили от фашистов. Город стоял в руинах: полностью были уничтожены текстилькомбинат, кожзавод, биофабрика, завод «Красный металлист», мельницы, мясокомбинат, хлебозавод, городские бани, АТС, телеграф, почта, электростанция. Общий ущерб составил сто пятьдесят три миллиона рублей.
С первых же дней после освобождения трудящиеся стали возрождать родной город. В 1943 году возобновили производство военной продукции на «Красном металлисте». Мастерские города, обувная фабрика, мельзавод № 5, мясокомбинат работали для фронта. В черкасовские бригады объединились около 1000 женщин. Драматический театр, сельскохозяйственный и педагогический институты, школы восстанавливали все, даже дети.