В XV веке правление городом перешло в руки князя Бориса Александровича. Этот период стал одним из последних «взлетов» Твери в политическом отношении. В то время город был центром самостоятельного княжества. Власти Твери вели внешнеполитическую деятельность, ее представители участвовали даже во Флорентийском соборе 1439—1442гг.
XV век – время активногоэкономического развития Твери, взлета строительства и архитектуры. В это время были построены одни из наиболее значительных архитектурных памятников города: церковь Михаила Архангела(1455), церковь Бориса и Глеба(1438) и др., возведены храмы на территориях Желтикового и Федоровского монастырей, известная соборная колокольня и др.
Однако, период расцвета города быстро завершился из-за ошибки в политическом курсе. Выступив на стороне Великого княжества Литовского против Москвы, князья потерпели поражение. В 1458 году город был занят восками Ивана III, и Тверь вместе с подчиненными ей территориями была включена в Московское княжество.
Впрочем, в торговом отношении город продолжал и в последующем XVI веке удерживать важные позиции. Конец развития торговли в городе положило нападение опричников под руководством Ивана Грозного в 1569 году.
К началу XVII века Тверь переживала и политический, социально-экономический упадок.