Местом ссылки Уфа стала служить в начале XVII в. Сюда ссылались люди по «политическим статьям» и попавшие в опалу государственной власти тех времен. В силу этих обстоятельств, ссыльные зачастую были хорошо образованы. Здесь также жили дворяне, которых прислали для несения государевой службы.
Уфимские ссыльные не отбывали свое наказание пожизненно. Сюда ссылались как проворовавшиеся воеводы (например, А.И. Репнин в 1601 г.), так и родственники будущего царя – И. и В. Романовы. В 1605 г. самозванец Лжедмитрий I сослал в Уфу окольничего царя Бориса Никиту Годунова.
Сюда же во время царствования Василия Шуйского был сослан посольский дьяк Афанасий Власьев (Безобразов). Сначала он состоял в когорте доверенных лиц царя Бориса. Затем, когда убили Федора Годунова, он стал сторонником Лжедмитрия I (Гришка Отрепьев), став впоследствии его окольничим, казначеем и великим секретарем.
Ссыльные, особенно политические, сыграли основополагающую роль в формировании и последующем развитии уфимской культуры XVIII–XIX в. Так, благодаря ссылке польских бунтовщиков в конце XVIII в., Уфа увидела первые театральные постановки. Начало XIX в. ознаменовало собой множественные ссылки участников массовых волнений: были сосланы военные и гражданские служащие, участвовавшие в восстаниях Семеновского полка и Чугуевском, декабристы, петрашевцы и пр.
К концу XIX в. в Уфу были сосланы многие народовольцы и революционеры из России, Польши, Литвы, Австро-Венгрии, Германии. И в XX в. Уфа продолжала выполнять функцию ссыльной территории уже для инакомыслящих, таких как, например, академик Любавский, профессор Кисельгоф и др.