В 1834 г. население аула Абин было отправлено на поселение в Турцию, а на месте поселения под руководством генерала Вельяминова выстроена Абинская крепость. Укрепление находилось на высоком левом берегу реки Абин и занимало площадь около 5 га. Границы укрепления имели форму шестиугольника. С внешней стороны крепость была защищена земляным валом высотой более 2 м и сухим рвом шириной глубиной до 4 м. Кроме того, укрепление имело мощную артиллерию, расположенную таким образом, что при залпах флангового и фронтального огня была охвачена вся прилегающая местность. Внутри укрепления на скорую руку были построены несколько казарм для солдат, три флигеля для коменданта гарнизона, офицеров, врача и священника, церковь и несколько сараев.
В 1854 году, во время Крымской войны, Абинское укрепление было упразднено, гарнизон выведен, сооружения разрушены. После окончания Кавказской войны в 1862 году было принято положение о заселении казаками западной части Северного Кавказа. Согласно этому положению, казаки из войск Адагумского отряда стали возводить новые станицы, большая часть которых располагалась на территории бывших укреплений. К северу от ранее разрушенного бастиона был выстроен и новый Абинский лагерь, куда была переведена штаб-квартира Крымского пехотного полка, пеший батальон и эскадрон Северского драгунского полка.
В апреле 1863 года был издан приказ о переселении азовских казаков на Кавказ. 8 (20 по старому стилю) мая 1863 года, когда первые шестнадцать казачьих семей под командованием урядника Г. Кулика прибыли в Абинский лагерь и приступили к строительным работам по сооружению жилых домов, официально считается датой основания станицы Абинской. В июне-июле в Абинский лагерь были перевезены еще 488 семей азовских казаков. Начальником станицы был назначен Георгиевский кавалер хорунжий Е. М. Гладкий. В конце июля состоялся первый общестаничный сбор, на котором избрали первых должностных лиц. К октябрю 1863 года станица была окончательно отстроена. В 1868 году на левом берегу реки Абин построена первая деревянная церковь в честь святителя Николая Чудотворца.
Шло строительство и образовательных учреждений. Осенью 1867 в станице Абинской была открыта первая школа, в ноябре 1874 года на средства Екатеринодарского благотворительного общества – женское училище, в 1897 году организована воскресная школа для взрослых.
В 1868 году близ станицы Абинской полковником А. И. Новосельцевым был открыт нефтяной источник. Это открытие дало начало успешной разработке нефтяных месторождений. В 1879 году в станице Абинской американский инженер Г. Тверддл установил первую нефтепроводную станцию. В 1880 году нефтяные промыслы в станице Абинской посетил великий русский ученый-химик Д. И. Менделеев.
Инфраструктура станицы постепенно развивалась. В 1885 году в станице построили маслобойный завод. В том же году через реку Абин был перекинут железнодорожный мост, а в 1887 году построено здание железнодорожной станции Абинская, которая стала одной из промежуточных станций на железнодорожной ветке Екатеринодар-Новороссийск.