Спасо-Преображенская церковь (Спасская или Преображенская церковь, как ее в обиходе принято называть среди местных жителей), давшая название городу Спас-Клепики, была построена не позднее третьей четверти XVII в. Существует несколько легенд о ее строительстве. Согласно одной из них, церковь была построена раскаявшимися разбойниками, орудовавшими на узко переправе через реку Пра. Другая версия утверждает, что церковь построили счастливые купцы, дабы воздать хвалу господу, изловив надоевших преступников.
Строительство последнего здания церковного ансамбля – колокольни, – завершилось в 1838-1842 годах, а в 1866 году она была перестроена. Здание церкви выполнено из дерева. В ней расположено два придела – Покровский и Алексеевский.
В связи с антиклерикальной политикой большевиков церковь была закрыта в начале 1930-х годов, а венчание сломано. В начале 1990-х годов церковь была возвращена христианской общине Сапс-Клепиков. Венчание было успешно восстановлено, хоть и несколько упрощено – в виде главки.